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Epidemiología y Bioinformática

Descripción

Equipo

Funciones

Servicios

Bases de datos

  • Recomendaciones para la recogida de datos así como codificación de variables.
  • Anonimizar o seudonimizar los datos.
  • Diseñar y desarrollar bases de datos (Excel, SPSS, SQL y Access).
  • REDCap:
    • Diseñar y crear cuadernos electrónicos de recogida de datos (CRD).
    • Estandarizar, armonizar y subir bases de datos, ya existentes, al entorno REDCap.

Big data

  • Data wrangling: Combinar, depurar, armonizar y organizar bases de datos.
  • Representar gráficamente los resultados de investigación.
  • Personalizar flujos de trabajo y automatizar tareas.
  • Pilotar y mantener aplicaciones web personalizadas.
  • Explotar los datos.
  • Inteligencia Artificial.

Bioinformática

  • Obtener datos de repositorios especializados para la extracción de datos a gran escala (datos clínicos, genómicos, expresión de tejido, anotación funcional, imágenes…).
  • Expresión diferencial de genes (Microarrays).
  • Next Generation Sequencing (NGS): Análisis de RNA-Seq, ChIP-Seq, ATAC-Seq y scRNA-Seq.
  • Analizar enriquecimiento funcional (caracterizar funciones biológicas, moleculares y componentes celulares a través de términos de Gene Ontology (GO) y analizar pathways (KEGG)).
  • Caracterizar splicing.
  • Instalar software bioinformático.

Análisis de los datos y bioestadística

  • Análisis estadístico descriptivo.
  • Estimación de tamaños muestrales.
  • Procedimientos de aleatorización.
  • Pruebas de contraste de hipótesis.
  • Análisis Multivariantes, regresión, supervivencia y curvas ROC, etc.

Proyectos de Investigación

  • Apoyo para la elaboración de proyectos de investigación, artículos, de evaluación de intervenciones, de evaluación de resultados en salud, de calidad asistencial, de seguridad de pacientes, comunicaciones a congreso, etc.
  • Diseño de protocolos.
  • Presentación de resultados (elaboración de tablas, gráficos, etc).
  • Asesoramiento científico (revisión de comunicaciones, publicaciones, etc).

Formación programada

  • R.
  • REDCap.
  • Metodología de la Investigación.
  • Epidemiología Avanzada.

Formación personalizada (a demanda fuera de la programación de formación ISABIAL)

  • R.
  • REDCap.
  • Otras bases de datos.

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Técnicas

Órganos de asesoramiento

Documentos

Plataformas

Confidencialidad de los datos

La Plataforma de Epidemiología y Bioinformática recomienda eliminar los SIP y DNI de los pacientes incluidos en las bases de datos que proporcionen a esta unidad. Deberá crearse un código identificador de paciente siguiendo las recomendaciones de seudonimización.

El investigador principal será responsable de seguir la pauta anterior, así como disponer del consentimiento informado de los participantes de su proyecto.

Contacto

EPIDEMIOLOGÍA

Dr. Pablo Chico Sánchez (Coordinador)
Dra. Paula Gras Valenti
Dr. José Sánchez Payá

epidemiologia@isabial.es
965 933 346

BIOINFORMÁTICA

Samanta Ortuño

bioinformatica@isabial.es
965 913 981

Ubicación

EPIDEMIOLOGÍA

Servicio de Medicina Preventiva H.G.U. Dr. Balmis, Planta baja, Bloque D
Hospital General Universitario Dr. Balmis
Avda. Pintor Baeza, 12, 03010 Alicante

BIOINFORMÁTICA

Planta 4ª, Centro de Diagnóstico (Edificio gris)
Hospital General Universitario Dr. Balmis
Avda. Pintor Baeza, 12, 03010 Alicante

Horario

EPIDEMIOLOGÍA

De lunes a viernes mañanas
8:00 a 15:00 h

Jueves tarde
15:00 a 20:00 h

BIOINFORMÁTICA

De lunes a viernes
9:00 a 14:30 h

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