Equipamiento
La plataforma trabaja con el equipo Real Time PCR Rotor Gene Q system (Qiagen), Applied Biosystems 7500 y Quantstudio 12k Flex, lo que permite la amplificación del ADN y la detección de los alelos de forma simultánea (discriminación alélica) en tandas desde 72 hasta 96 pocillos. Se cuenta con sondas específicas TaqMan MGB® y con material (moldes, placas y reactivos/geles) para la realización de electroforesis. Se dispone de placas de SNPs customizadas para el análisis mediante técnicas de Array provistas por ThermoFisher.
El Laboratorio de Apoyo a la Investigación (LAI) de ISABIAL dispone de la infraestructura apropiada, incluyendo salas y bancadas específicas, así como de congeladores a distintas temperaturas para el almacenamiento de las muestras biológicas (sangre, pellet, saliva, ADN, entre otras), material general de laboratorio y equipamiento informático (portátil y de sobremesa) para el registro y análisis de datos y emisión de resultados.
Anexos
Listado de SNPs incluidos en el panel de genes relacionados con la medicina del dolor.
Gen | SNP ID |
---|---|
CYP2D6 *2 | rs1080985 |
CYP2D6 *2 | rs16947 |
CYP2D6 *3 | rs35742686 |
CYP2D6 *4 | rs3892097 |
CYP2D6 *6 | rs5030655 |
CYP2D6 *7 | rs5030867 |
CYP2D6 *9 | rs5030656 |
CYP2D6 *10 | rs1065852 |
CYP2D6 *12 | rs5030862 |
CYP2D6 *14 | rs5030865 |
CYP2D6 *15 | rs774671100 |
CYP2D6 *17 | rs28371706 |
CYP2D6 *29 | rs59421388 |
CYP2D6 *35 | rs769258 |
CYP2D6 *39 | rs1135840 |
CYP2D6 *41 | rs28371725 |
OPRM1 | rs1799971 |
COMT | rs4680 |
COMT | rs4633 |
CYP3A4*1G | rs2242480 |
CYP3A4*18 | rs28371759 |
CYP3A4*1B | rs2740574 |
CYP3A4*2 | rs55785340 |
CYP3A4*17 | rs4987161 |
CYP3A4*22 | rs35599367 |
ABCB1 | rs1045642 |
ABCB1 | rs1128503 |
ABCB1 | rs2032582 |
OPRK1 | rs1051660 |
UGT2B7*2B | rs7668258 |
UGT2B7 (G211T) | rs12233719 |
UGT2B7 (A842G) | rs7438135 |
ARRB2 (C8622T) | rs1045280 |
OPRD1 (C921T) | rs2234918 |
Listado de fármacos que actúan como inductores, inhibidores y sustratos de la enzima CYP2D6.
[gris oscuro]: analgésicos; [gris intermedio]: antidepresivos y ansiolíticos; [gris claro]: coadyuvantes en medicina del dolor; [blanco]: miscelánea;Inductores | Inhibidores | Sustratos | |
---|---|---|---|
Dexametasona | Celecoxib | Oxycodone | Codeina |
Oritavancina | Metadona | Tramadol | Imipramine |
Rifampicina | Doxepina | Nortriptyline | Fluvoxamine |
Escitalopram | Escitalopram | Amitriptylina | |
Citalopram | Citalopram | Clomipramina | |
Duloxetina | Atomoxetina | Desipramina | |
Paroxetina | Duloxetina | Venlafaxina | |
Sertralina | Paroxetina | Doxepina | |
Bupropion | Fluoxetina | Lidocaine | |
Clomipramina | Dextrometorfano | Clonidina | |
Clobazam | Anfetamina | Haloperidol | |
Clorpromazina | Metoxi anfetamine | Risperidone | |
Haloperidol | Clorpromazina | Debrisoquina | |
Cocaína | Encainida | Carvedilol | |
Amiodarona | Flecainida | Perfenazina | |
Metoclopramida | Perhexilina | Pomalidomid | |
Moclobemida | Eliglustat | Ponatinib | |
Panobinostat | Pimavanserina | Prometazina | |
Perfenazina | Vilazodona | Propafenona | |
Prometazina | Thioridazina | Propranolol | |
Difenhidramina | Timolol | Aripiprazol | |
Ritonavir | Umeclidinium | Rucaparib | |
Rolapitant | Valbenazina | Donepezilo | |
Terbinafina | Sparteina | Phenacetina | |
Ticlopidina | Tamoxifeno | Ibrutinib | |
Tripelennamina | Tetrabenzina | Metoprolol | |
Cimetidina | Letermovir | Mexiletina | |
Cinacalcet | Fenformina | Minaprina | |
Clemastina | Clorfeniramina | Nebivolol | |
Quinidina | Deutetrabenazina | Netupitant/ palonosetron |
|
Ranitidina | Dexfenfluramina | Zuclopenthixol | |
Halofantrina | Alprenolol | Brexpiprazol | |
Hidroxicina | Metoclopramida | Bufuralol | |
Levomepromazina | Ibrutinib | Cariprazina | |
Lorcaserina | Ondansetron | ||
Midodrina | |||
Abiraterona |
Listado disponible en el link: CYTOCHROME P450 DRUG INTERACTION TABLE – Drug Interactions (iu.edu)
Listado de SNPs incluidos en el estudio de genes reloj.
Gen | SNP ID |
---|---|
NPAS2 | rs1811399 |
PER1 | rs885747 |
PER 1 | rs6416892 |
ASMT | rs4446909 |
ASMT | rs5989681 |