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Unidad de Farmacogenética

Descripción

La plataforma de Farmacogenética aplicada a la investigación de ISABIAL pone a disposición de la comunidad médica y científica, tanto de ISABIAL como de otras instituciones públicas o privadas, todo su conocimiento y experiencia y ofrece soporte para la realización de estudios de marcadores genéticos asociados a la respuesta a los tratamientos farmacológicos, como aproximación a la medicina de precisión.

Equipo

Funciones

Servicios

  • Extracción, purificación y cuantificación de ADN.
  • Determinación de polimorfismos a través de técnicas de RT-PCR.
  • Análisis de variación en el número de copias en genes seleccionados mediante qPCR.
  • Asesoramiento para el diseño de arrays customizados con ensayos de polimorfismos.
  • Estimación del fenotipo metabolizador basado en el genotipo CYP2D6.
  • Estudio de ritmo circadiano del sueño incluyendo el genotipado de los genes reloj.
  • Estudio epigenético a través del análisis de microRNA.
  • Emisión de informe farmacogenético de resultados.
  • Disponibilidad para consultas acerca de la interpretación de resultados.

Se determinan polimorfismos de un solo nucleótido (SNP, Single Nucleotide Polymorphism) validados por la FDA y la EMA, en algunos casos también incluidos en Ficha Técnica de los fármacos, así como SNPs propuestos en la literatura y/o recogidos en Pharma-GKB, a demanda.

Actualmente, se dispone de forma predefinida de paneles de SNPs de genes vinculados con la farmacocinética (metabolismo y transporte) y farmacodinámica de analgésicos y psicótropos (Anexo I). No obstante, se ofrece asesoramiento en el diseño de arrays customizados de SNPs/genes de cualquier otro campo de la Biomedicina para el desarrollo de estudios de investigación: prospectivos, retrospectivos; por patología, por gen, por fármaco; o a nivel de investigación traslacional.

Se realizan estudios de clasificación del perfil metabolizador (lento, intermedio, normal o ultra-rápido) del paciente a partir del genotipado de SNPs en el gen de la enzima CYP2D6, encargada del metabolismo de un elevado número de fármacos comercializados (Anexo II).

Se ofrecen estudios del ritmo circadiano del sueño incluyendo monitorización circadiana ambulatoria y análisis de cortisol, melatonina y α-amilasa. Además, se oferta el genotipado de los genes reloj, relacionados con procesos circadianos y que regulan los tiempos de maduración del sistema nervioso central, la melatonina, la serotonina y el GABA, moléculas que juegan un rol importante en la regulación del sueño y los problemas de ritmo circadiano (Anexo III).

La epigenética estudia los mecanismos que regulan la expresión génica sin modificar la secuencia del ADN. Estos mecanismos incluyen a los micro-ARN (ARN no codificante), que permiten la activación o la represión de los genes jugando un papel relevante en los numerosos procesos biológicos.

Asimismo, se incluye la emisión de un informe farmacogenético de resultados que contiene:

  • El resultado genotípico del paciente, con información sobre el gen y SNPs estudiados, así como las frecuencias poblacionales esperadas para cada variante genética.
  • Significado biológico de las variantes que pudiera presentar el paciente.
  • Recomendación farmacológica sobre el tratamiento y dosificación asociada a las variantes detectadas en base a la evidencia científica actualmente disponible.
  • Información acerca de la existencia de servicios adicionales que se ofrezcan en el Hospital General Universitario Dr. Balmis de Alicante y que puedan aportar información adicional sobre el caso particular.

Técnicas

Órganos de asesoramiento

Documentos

Plataformas

Equipamiento

La plataforma trabaja con el equipo Real Time PCR Rotor Gene Q system (Qiagen), Applied Biosystems 7500 y Quantstudio 12k Flex, lo que permite la amplificación del ADN y la detección de los alelos de forma simultánea (discriminación alélica) en tandas desde 72 hasta 96 pocillos. Se cuenta con sondas específicas TaqMan MGB® y con material (moldes, placas y reactivos/geles) para la realización de electroforesis. Se dispone de placas de SNPs customizadas para el análisis mediante técnicas de Array provistas por ThermoFisher.

El Laboratorio de Apoyo a la Investigación (LAI) de ISABIAL dispone de la infraestructura apropiada, incluyendo salas y bancadas específicas, así como de congeladores a distintas temperaturas para el almacenamiento de las muestras biológicas (sangre, pellet, saliva, ADN, entre otras), material general de laboratorio y equipamiento informático (portátil y de sobremesa) para el registro y análisis de datos y emisión de resultados.

Anexos

Listado de SNPs incluidos en el panel de genes relacionados con la medicina del dolor.

Gen SNP ID
CYP2D6 *2 rs1080985
CYP2D6 *2 rs16947
CYP2D6 *3 rs35742686
CYP2D6 *4 rs3892097
CYP2D6 *6 rs5030655
CYP2D6 *7 rs5030867
CYP2D6 *9 rs5030656
CYP2D6 *10 rs1065852
CYP2D6 *12 rs5030862
CYP2D6 *14 rs5030865
CYP2D6 *15 rs774671100
CYP2D6 *17 rs28371706
CYP2D6 *29 rs59421388
CYP2D6 *35 rs769258
CYP2D6 *39 rs1135840
CYP2D6 *41 rs28371725
OPRM1 rs1799971
COMT rs4680
COMT rs4633
CYP3A4*1G rs2242480
CYP3A4*18 rs28371759
CYP3A4*1B rs2740574
CYP3A4*2 rs55785340
CYP3A4*17 rs4987161
CYP3A4*22 rs35599367
ABCB1 rs1045642
ABCB1 rs1128503
ABCB1 rs2032582
OPRK1 rs1051660
UGT2B7*2B rs7668258
UGT2B7 (G211T) rs12233719
UGT2B7 (A842G) rs7438135
ARRB2 (C8622T) rs1045280
OPRD1 (C921T) rs2234918

Listado de fármacos que actúan como inductores, inhibidores y sustratos de la enzima CYP2D6.

[gris oscuro]: analgésicos; [gris intermedio]: antidepresivos y ansiolíticos; [gris claro]: coadyuvantes en medicina del dolor; [blanco]: miscelánea;

Inductores Inhibidores Sustratos
Dexametasona Celecoxib Oxycodone Codeina
Oritavancina Metadona Tramadol Imipramine
Rifampicina Doxepina Nortriptyline Fluvoxamine
Escitalopram Escitalopram Amitriptylina
Citalopram Citalopram Clomipramina
Duloxetina Atomoxetina Desipramina
Paroxetina Duloxetina Venlafaxina
Sertralina Paroxetina Doxepina
Bupropion Fluoxetina Lidocaine
Clomipramina Dextrometorfano Clonidina
Clobazam Anfetamina Haloperidol
Clorpromazina Metoxi anfetamine Risperidone
Haloperidol Clorpromazina Debrisoquina
Cocaína Encainida Carvedilol
Amiodarona Flecainida Perfenazina
Metoclopramida Perhexilina Pomalidomid
Moclobemida Eliglustat Ponatinib
Panobinostat Pimavanserina Prometazina
Perfenazina Vilazodona Propafenona
Prometazina Thioridazina Propranolol
Difenhidramina Timolol Aripiprazol
Ritonavir Umeclidinium Rucaparib
Rolapitant Valbenazina Donepezilo
Terbinafina Sparteina Phenacetina
Ticlopidina Tamoxifeno Ibrutinib
Tripelennamina Tetrabenzina Metoprolol
Cimetidina Letermovir Mexiletina
Cinacalcet Fenformina Minaprina
Clemastina Clorfeniramina Nebivolol
Quinidina Deutetrabenazina Netupitant/
palonosetron
Ranitidina Dexfenfluramina Zuclopenthixol
Halofantrina Alprenolol Brexpiprazol
Hidroxicina Metoclopramida Bufuralol
Levomepromazina Ibrutinib Cariprazina
Lorcaserina Ondansetron
Midodrina
Abiraterona

Listado disponible en el link: CYTOCHROME P450 DRUG INTERACTION TABLE – Drug Interactions (iu.edu)

Listado de SNPs incluidos en el estudio de genes reloj.

Gen SNP ID
NPAS2 rs1811399
PER1 rs885747
PER 1 rs6416892
ASMT rs4446909
ASMT rs5989681

Contacto

Dra. Ana María Peiró (Coordinadora-Responsable)
Mónica Escorial (Subcoordinadora)
Dr. Javier Muriel

farmacogenetica@isabial.es
965 913 868

Ubicación

Planta 6ª, Centro de Diagnóstico (Edificio gris)
Hospital General Universitario Dr. Balmis
Avda. Pintor Baeza, 12, 03010 Alicante

Horario

De lunes a viernes
9:00 a 14:30 h

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