FARMACOGENÉTICA APLICADA A LA INVESTIGACIÓN Esta plataforma de ISABIAL pone a disposición de la comunidad médica y científica, tanto de ISABIAL como de otras instituciones públicas o privadas, todo su conocimiento y experiencia y ofrece soporte para la realización de estudios de marcadores genéticos asociados a la respuesta a los tratamientos farmacológicos, como aproximación a la medicina de precisión.

Servicios

  • Extracción, purificación y cuantificación de ADN.
  • Determinación de polimorfismos a través de técnicas de RT-PCR.
  • Análisis de variación en el número de copias en genes seleccionados mediante qPCR.
  • Asesoramiento para el diseño de arrays customizados con ensayos de polimorfismos.
  • Estimación del fenotipo metabolizador basado en el genotipo CYP2D6.
  • Estudio de ritmo circadiano del sueño incluyendo el genotipado de los genes reloj.
  • Estudio epigenético a través del análisis de microRNA.
  • Emisión de informe farmacogenético de resultados.
  • Disponibilidad para consultas acerca de la interpretación de resultados.

Se determinan polimorfismos de un solo nucleótido (SNP, Single Nucleotide Polymorphism) validados por la FDA y la EMA, en algunos casos también incluidos en Ficha Técnica de los fármacos, así como SNPs propuestos en la literatura y/o recogidos en Pharma-GKB, a demanda.

Actualmente, se dispone de forma predefinida de paneles de SNPs de genes vinculados con la farmacocinética (metabolismo y transporte) y farmacodinámica de analgésicos y psicótropos (Anexo I). No obstante, se ofrece asesoramiento en el diseño de arrays customizados de polimorfismos/genes de cualquier otro campo de la Biomedicina para el desarrollo de estudios de investigación: prospectivos, retrospectivos; por patología, por gen, por fármaco; o a nivel de investigación traslacional.

Se realizan estudios de clasificación del perfil metabolizador (lento, intermedio, normal o ultra-rápido) del paciente a partir del genotipado de SNPs en el gen de la enzima CYP2D6, encargada del metabolismo de un elevado número de fármacos comercializados (Anexo II).

Se ofrecen estudios del ritmo circadiano del sueño incluyendo monitorización circadiana ambulatoria y análisis de cortisol, melatonina y α-amilasa. Además, se oferta el genotipado de los genes reloj, relacionados con procesos circadianos y que regulan los tiempos de maduración del sistema nervioso central, la melatonina, la serotonina y el GABA, moléculas que juegan un rol importante en la regulación del sueño y los problemas de ritmo circadiano (Anexo III).

La epigenética estudia los mecanismos que regulan la expresión génica sin modificar la secuencia del ADN. Estos mecanismos incluyen a los micro-ARN (ARN no codificante), que permiten la activación o la represión de los genes jugando un papel relevante en los numerosos procesos biológicos.

Asimismo, se incluye la emisión de un informe farmacogenético de resultados que contiene:

  • El resultado genotípico del paciente, con información sobre el gen y SNPs estudiados, así como las frecuencias poblacionales esperadas para cada variante genética.
  • Significado biológico de las variantes que pudiera presentar el paciente.
  • Recomendación farmacológica sobre el tratamiento y dosificación asociada a las variantes detectadas en base a la evidencia científica actualmente disponible.
  • Información acerca de la existencia de servicios adicionales que se ofrezcan en el Hospital General Universitario Dr. Balmis de Alicante y que puedan aportar información adicional sobre el caso particular.

Equipamiento

La plataforma trabaja con el equipo Real Time PCR Rotor Gene Q system (Qiagen), Applied Biosystems 7500 y Quantstudio 12k Flex, lo que permite la amplificación del ADN y la detección de los alelos de forma simultánea (discriminación alélica) en tandas desde 72 hasta 96 pocillos. Se cuenta con sondas específicas TaqMan MGB® y con material (moldes, placas y reactivos/geles) para la realización de electroforesis. Se dispone de placas de SNPs customizadas para el análisis mediante técnicas de Array provistas por ThermoFisher.

El Laboratorio de Apoyo a la Investigación (LAI) de ISABIAL dispone de la infraestructura apropiada, incluyendo salas y bancadas específicas, así como de congeladores a distintas temperaturas para el almacenamiento de las muestras biológicas (sangre, pellet, saliva, ADN, entre otras), material general de laboratorio y equipamiento informático (portátil y de sobremesa) para el registro y análisis de datos y emisión de resultados.

Anexos

Listado de SNPs incluidos en el panel de genes relacionados con la medicina del dolor.

Gen

SNP ID

CYP2D6 *2

rs1080985

CYP2D6 *2

rs16947

CYP2D6 *3

rs35742686

CYP2D6 *4

rs3892097

CYP2D6 *6

rs5030655

CYP2D6 *7

rs5030867

CYP2D6 *9

rs5030656

CYP2D6 *10

rs1065852

CYP2D6 *12

rs5030862

CYP2D6 *14

rs5030865

CYP2D6 *15

rs774671100

CYP2D6 *17

rs28371706

CYP2D6 *29

rs59421388

CYP2D6 *35

rs769258

CYP2D6 *39

rs1135840

CYP2D6 *41

rs28371725

OPRM1

rs1799971

COMT

rs4680

COMT

rs4633

CYP3A4*1G

rs2242480

CYP3A4*18

rs28371759

CYP3A4*1B

rs2740574

CYP3A4*2

rs55785340

CYP3A4*17

rs4987161

CYP3A4*22

rs35599367

ABCB1

rs1045642

ABCB1

rs1128503

ABCB1

rs2032582

OPRK1

rs1051660

UGT2B7*2B

rs7668258

UGT2B7 (G211T)

rs12233719

UGT2B7 (A842G)

rs7438135

ARRB2 (C8622T)

rs1045280

OPRD1 (C921T)

rs2234918

Listado de fármacos que actúan como inductores, inhibidores y sustratos de la enzima CYP2D6 [gris oscuro: analgésicos; gris intermedio: antidepresivos y ansiolíticos; gris claro: coadyuvantes en medicina del dolor; blanco: miscelánea]
Inductores Inhibidores Sustratos
Dexametasona Celecoxib Oxycodone Codeina
Oritavancina Metadona Tramadol Imipramine
Rifampicina Doxepina Nortriptyline Fluvoxamine

Escitalopram Escitalopram Amitriptylina

Citalopram Citalopram Clomipramina

Duloxetina Atomoxetina Desipramina

Paroxetina Duloxetina Venlafaxina

Sertralina Paroxetina Doxepina

Bupropion Fluoxetina Lidocaine

Clomipramina Dextrometorfano Clonidina

Clobazam Anfetamina Haloperidol

Clorpromazina Metoxi anfetamine Risperidone

Haloperidol Clorpromazina Debrisoquina

Cocaína Encainida Carvedilol

Amiodarona Flecainida Perfenazina

Metoclopramida Perhexilina Pomalidomid

Moclobemida Eliglustat Ponatinib

Panobinostat Pimavanserina Prometazina

Perfenazina Vilazodona Propafenona

Prometazina Thioridazina Propranolol

Difenhidramina Timolol Aripiprazol

Ritonavir Umeclidinium Rucaparib

Rolapitant Valbenazina Donepezilo

Terbinafina Sparteina Phenacetina

Ticlopidina Tamoxifeno Ibrutinib

Tripelennamina Tetrabenzina Metoprolol

Cimetidina Letermovir Mexiletina

Cinacalcet Fenformina Minaprina

Clemastina Clorfeniramina Nebivolol

Quinidina Deutetrabenazina Netupitant/
palonosetron

Ranitidina Dexfenfluramina Zuclopenthixol

Halofantrina Alprenolol Brexpiprazol

Hidroxicina Metoclopramida Bufuralol

Levomepromazina Ibrutinib Cariprazina
Lorcaserina Ondansetron
Midodrina
Abiraterona
Listado disponible en el link: CYTOCHROME P450 DRUG INTERACTION TABLE – Drug Interactions (iu.edu)

Listado de SNPs incluidos en el estudio de genes reloj.

 

Gen

SNP ID

NPAS2

rs1811399

PER1

rs885747

PER 1

rs6416892

ASMT

rs4446909

ASMT

rs5989681

 

Tarifas

Tarifa A Tarifa B
N>15 N<15 N>15 N<15
Extracción y cuantificación de DNA 25 40 30 50
Genotipado de SNPs por RT-PCR (a demanda) 25 40 30 50
Análisis de variación en el número de copias en genes seleccionados mediante qPCR 25 40 30 50
Genotipado – Panel de SNPs (medicina del dolor) 300 500 375 650
Estudios de fenotipo metabolizador CYP2D6 100 150 125 190
Estudio y análisis del ritmo circadiano del sueño 150 200 190 250
Genotipado – SNPs en los genes reloj 250 270 265 290
Análisis de micro-ARN (Epigenética) 50 70 65 90
Asesoramiento experto en el diseño de arrays customizables de genes/polimorfismos (precio por hora) 20 25
Asesoramiento experto en el diseño de proyectos de investigación farmacogenéticos Coste personalizado en función de la complejidad y duración del proyecto
Elaboración de Informe Farmacogenético individualizado, con recomendaciones basadas en la evidencia 4 5 5 6
Precios en € (IVA no incl.) Se aplicará el IVA vigente en cada momento.
N: Número de determinaciones
SNPs: Polimorfismos de un solo nucleótido (Single Nucleotide Polymorphism)
Descripción Tarifas:
  • Tarifa A: Personal investigador perteneciente a ISABIAL
  • Tarifa B: Otros organismos públicos o privados de investigación

Contacto

Directora: 

Dra. Ana María Peiró – 965 913 868

Coordinador: 

Dr. Javier Muriel Serrano

farmacogenetica@isabial.es

Ubicación

Planta 6ª, Centro de Diagnóstico (Edificio gris)
Hospital General Universitario de Alicante
Avda Pintor Baeza, 12, 03010 Alicante

Horario

De lunes a viernes
9:00 a 14:30 h