UNIDAD DE BIOINFORMÁTICA Esta plataforma, siempre en desarrollo, aporta a los investigadores un apoyo y/o asesoramiento en técnicas avanzadas de minería de datos y métodos actualizados de biología computacional a escala masiva. Esto permite el impulso de los estudios, tanto básicos como clínicos, analizando e interpretando los datos obtenidos mediante técnicas experimentales de alto rendimiento

Servicios

  1. Diseño experimental. Asesoramiento para el diseño del estudio y la planificación metodológica.
  2. Apoyo en redacción de documentos. Parte bioinformática de memorias, artículos científicos, comunicaciones a congresos y/o solicitud de ayudas.
  3. Análisis de datos. Procesamiento bioinformático de los datos obtenidos en diversas plataformas.
    • Minería de datos. Manejo y representación de información relevante de bases de datos, bibliotecas o archivos de grandes dimensiones.
    • Bases de datos. Diseño, creación y administración de bases de datos (Access, SQL o NoSQL) adaptadas.
    • Pipelines bioinformáticas. RNA-seq (single cell, micro, total, ribosómico o nuclear), ChIP-seq, ATAC-seq…
    • Repositorios públicos. Subida de datos a repositorios públicos (p.ej. GEO y SRA)
    • Interpretación de los resultados.
  4. Apoyo en REDCap. Creación y/o diseño de los proyectos, así como la explotación de los datos recolectados.
  5. Formación personalizada.
  6. Posibilidad de desarrollo de aplicaciones informáticas personalizadas.

 

Dichos servicios se irán ampliando conforme a las necesidades que surjan.

Técnicas

  • Procesamiento de muestras de sangre periférica y tejidos.
  • Extracción de ácidos nucleicos. Análisis de pureza, integridad y funcionalidad.

Formulario solicitud

El procedimiento para solicitar apoyo a la plataforma de bioinformática es:

  1. Reunión para poner en común y clarificar en profundidad el problema o análisis correspondiente.
  2. Preparación y entrega de los datos a la unidad.
  3. Rellenar el formulario.
  4. Realización del análisis y reuniones para aclarar dudas.
  5. Entrega de resultados en los formatos pertinentes.

Tarifas

Tipo de muestra Tarifa A Tarifa BTarifa C
Alícuota suero 0,0€ 4,5€ 6,6€
Alícuota plasma 0,0€ 4,6€ 6,7€
Pellet CMSP 0,0€ 3,8€ 6,3€
Sangre periérica completa criopreservada* 0,0€ 3,2€ 5,8€
Tejido fijado-punch 0,0€ 2,1€ 3,3€
Tejido fijado-corte en tubo (1er corte) 0,0€ 2,2€ 3,3€
Tejido fijado-corte en tubo (cortes adicionales) 0,0€ 0,6€ 0,8€
Tejido fijado-corte porta (1er corte) 0,0€ 2,8€ 4,0€
Tejido fijado-corte porta (cortes adicionales) 0,0€ 0,7€ 0,9€
Tejido fijado-corte porta IHQ 0,0€ 3,1€ 4,5€
Tejido criopreservado-corte porta (1er corte) 0,0€ 2,6€ 4,3€
Tejido criopreservado-corte porta (cortes adicionales) 0,0€ 0,8€ 1,1€
Tejido criopreservado-corte en tubo (1er corte) 0,0€ 2,4€ 4,3€
Tejido criopreservado-corte en tubo (cortes adicionales) 0,0€ 0,8€ 1,0€
Tejido criopreservado-fragmento RNA later 0,0€ 4,7€ 7,3€
Otros fluidos (LCR, lavado nasal 500 uL-1mL) 0,0€ 3,4€ 6,0€
Heces criopreservadas en RNA later (500 uL) 0,0€ 4,2€ 6,7€
ADN de sangre periférica (1 ug) 0,0€ 4,9€ 7,8€
ADN de tejido fijado o criopreservado (1 ug) 0,0€ 4,3€ 6,9€
ARN de sangre periférica (1 ug) 0,0€ 4,9€ 7,8€
ARN de tejido fijado o criopreservado (1 ug) 0,0€ 5,2€ 8,2€
Custodia de material biológico (1 año):
Caja 81 tubos: 14,5€ 18,6€ 27,9€
Caja 96 tubos: 13,0€ 15,5€ 23,2€
Procesamiento de muestras para proyectos o ensayos clínicos Consultar
* Tubo EDTA. Consultar tarifa si se requiere otro tipo de tubo
Descripción Tarifas:
  • Tarifa A: Personal investigador perteneciente a ISABIAL
  • Tarifa B: Personal investigador externo a ISABIAL con financiación pública
  • Tarifa C: Personal investigador externo a ISABIAL con financiación privada
Las tarifas se han calculado en base al modelo de repercusión de costes elaborado por la Red Valenciana de Biobancos (aprobado en 2017).

Contacto

Samanta Ortuño Miquel 

965 913 954 

bioinformatica@isabial.es

Ubicación

Planta 6ª, Centro de Diagnóstico (Edificio gris)
Hospital General Universitario Dr. Balmis
Avda Pintor Baeza, 12, 03010 Alicante

Horario

De lunes a viernes
9:00 a 14:30 h